租车公司是指一种经营汽车租赁业务的企业，主要提供汽车租赁服务。在我国，租车公司的管理机构主要分为两个部门，即交通运输部门和工商管理部门。
交通运输部门是指国家交通运输部及其下属的各级交通运输主管部门，如省级交通运输局、市级交通运输局等。根据《道路运输条例》和《汽车租赁管理暂行办法》，租车公司需要经过交通运输部门的审批才能开展汽车租赁业务。交通运输部门主要负责以下工作：
1. 租车公司的审批：交通运输部门会根据租车公司的资质、经营计划、车辆情况等相关信息进行审批，确保租车公司符合相关规定，具备从事汽车租赁业务的资格。
2. 租车公司的监管：交通运输部门会对租车公司的经营行为进行监管，包括车辆的安全性、服务质量等方面，确保租车公司的经营行为合法、规范。
3. 租车公司的处罚：如果租车公司存在违法违规行为，交通运输部门有权对其进行处罚，包括罚款、暂停业务等。
工商管理部门是指国家工商行政管理总局及其下属的各级工商行政管理部门，如省级工商行政管理局、市级工商行政管理局等。工商管理部门主要负责以下工作：
1. 租车公司的登记：租车公司需要在工商管理部门进行登记，获得营业执照，方可开展经营活动。
2. 租车公司的监管：工商管理部门会对租车公司的经营行为进行监管，包括经营范围、资质等方面，确保租车公司的经营行为合法、规范。
3. 租车公司的处罚：如果租车公司存在违法违规行为，工商管理部门有权对其进行处罚，包括罚款、吊销营业执照等。
综上所述，租车公司的管理机构主要包括交通运输部门和工商管理部门，二者各负其责，确保租车公司的经营行为合法、规范。如果您需要租车服务，建议选择具备合法资质、服务质量有保障的租车公司。